A petición del Grupo Tinglar en el 1998, técnicos del Jardín Botánico Nacional realizaron un estudio de la flora de la Laguna Cabral. En este estudio se pudo colectar muestras de la flora del Refugio y en el informe se incorporó una lista que contiene ciento noventa y cuatro (194) especies de plantas, correspondientes a 61 familias.Entre estas especies de flora, se encuentran en la Laguna ocho (8) endémicas de la Isla La Española. Estos son Justicia abeggii, Tournefortia sufruticosa, Neoabbottia paniculata (Cagüey), Malpighia micropetala, Abutilon buchii (Cotón Marrón), Abutilon leonardii, Scolosanthus triacanthus (Vidrio), Solanum microphyllum.
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